別にシリーズにするつもりはなかったのですが、CS4になって日が浅いので、こちら等を見習って書いてみます。

ムービークリップインスタンスを選択した状態の変形パネル。何やら見慣れない矢印アイコンが。

クリックしてみると、なんとインスタンスのスケールが初期値に！

CS3でも両方100%指定すれば戻せたような気もしますが、一発で戻せると分かっていれば作業も少し大胆に行えるのではないでしょうか。ちょっとした事でも、知っていれば済むことは早々に回収していきたいものです。